間違えてwhileの中でSoundの定義してしまい、アセットの生成と破棄を繰り返していますみたいなエラーが起きたのですが、その後visualstudioのリソースビューにコードのファイル名が表示されなくなり（左側にもともと開いていたファイルのコードは表示されています）、コンパイルしても実行できなくなりました。開き直しても、ほかのプロジェクトでも同じようになります。
ファイルは残っているのですが原因はわかりますか？

誤操作が原因です。Siv3D は無関係です。
ソースファイルの一覧を表示するのは「リソース ビュー」ではなく「ソリューション エクスプローラー」です。
Visual Studio の表示メニューからソリューションエクスプローラーの表示を有効にしてください。