アプリの作成中に、「run-time check failure #0」というエラーがおき、プログラムが実行しなくなってしまいました。調べたところ、「CPlayer」と名づけたクラスを宣言し、純粋仮想関数をオーバーライドしたのが原因のようでした。他の文字を継ぎ足す（末尾に適当な文字を入れる）、全て小文字、或いは大文字等ではエラーは起きませんでした。

製作者様、ならびに皆様のほうで再現していただけると幸いです。

念のため、エラーを再現する際に用いたソースを以下に転載致します。

(Header.h)
#pragma once

class a//適当な名前のクラス
{
protected:
	virtual void b()=0;//純粋仮想関数
};

（Header1.h）
#pragma once
#include"Header.h"
class CPlayer:a	//問題の名称
{
public:
	void b()override　//純粋仮想関数をオーバーライド
	{
		
	}
};

(Main.cpp)
# include <Siv3D.hpp>
#include"Header1.h"
void Main()
{
	std::unique_ptr<CPlayer>p = std::make_unique<CPlayer>();
	while (System::Update())
	{
		p->b();	//エラーが発生する
	}
}

Siv3D 側の誤りです。
Siv3D エンジンの内部で同名のクラスが定義されていたことが原因です。
将来のバージョンで、クラス名の重複が起こらないよう修正します。

現時点での対処法は、クラス名の変更か、名前空間の使用です。

# include <Siv3D.hpp>

namespace myNamespace
{
	class IPlayer
	{
	public:
		
		~IPlayer() = default;

		virtual void doSomething() = 0;
	};

	class CPlayer : public IPlayer
	{
	public:

		void doSomething() override {}
	};
}

void Main()
{
	using namespace myNamespace;

	std::unique_ptr<IPlayer> p = std::make_unique<CPlayer>();
	
	while (System::Update())
	{
		p->doSomething(); // OK
	}
}

クラスを変更することで対処いたしました。ご対応感謝いたします。